Служба веб-публикаций отключена или отсутствует_ShouldReRunSetupForW3SVC
Содержимое этой статьи не обновлялось для Microsoft Exchange Server 2013. Несмотря на отсутствие обновления, оно может быть применимо для Exchange 2013. Если вам все еще нужна помощь, ознакомьтесь с указанными ниже ресурсами сообщества.
Возникли проблемы? Обратитесь за помощью к участникам форумов Exchange. Посетите форумы по адресу Exchange Server.
Не удается продолжить установку Microsoft® Exchange Server 2007, так как при попытке установить роль почтового сервера или клиентского доступа обнаружено, что служба публикации в Интернете отключена или не установлена на этом компьютере.
Необходимо, чтобы на компьютере, на который устанавливается Microsoft Exchange, была установлена и не отключена служба публикации в Интернете.
Чтобы устранить эту проблему, убедитесь, что служба публикации в Интернете установлена и не отключена на локальном компьютере, а затем повторно запустите программу установки Microsoft Exchange.
Чтобы убедиться, что служба публикации в Интернете установлена и не отключена:
- Щелкните правой кнопкой мыши Мой компьютер и выберите Управление.
- Разверните узел Службы и приложения, а затем выберите узел Службы.
- В области справа найдите Служба публикации в Интернете. Если Служба публикации в Интернете не отображается в списке установленных служб, установите ее, выполнив описанные ниже действия.
- Если Служба публикации в Интернете отображается, но не запущена, ее нужно запустить, выполнив указанные ниже действия.
- Щелкните правой кнопкой мыши Служба публикации в Интернете и выберите Свойства.
- Убедитесь, что параметр Тип запуска имеет значение Автоматически, а служба находится в состоянииРаботает.
- Чтобы выполнить поиск абонентской группы для пользователя в поле Абонентская группа (телефонный контекст), нажмите кнопку Обзор.
Установка службы публикации в Интернете
- В меню Пуск щелкните Настройки, выберите Панель управления и щелкните Установка и удаление программ.
- Щелкните Добавление и удаление компонентов Windows.
- В списке Компоненты установите флажок Сервер приложений и нажмите кнопку Сведения.
- Выберите Диспетчер служб IIS и нажмите кнопку Сведения.
- Выберите Служба Интернета, а затем установите флажок.
- Дважды нажмите кнопку ОК для возврата к списку Компоненты, а затем нажмите кнопку Далее.
- Когда службы IIS будут установлены, нажмите кнопку Готово.
Роли, службы ролей и компоненты, включенные в Windows Server — Core
Обычно мы говорим о том, что не в серверной ядре, теперь мы будем пытаться использовать другой подход и рассказать вам, что включено и что установлено по умолчанию. Следующие роли, службы ролей и компоненты находятся в параметре установки основных серверных компонентов Windows Server. Используйте эти сведения, чтобы узнать, работает ли параметр Server Core для вашей среды. Так как это большой список, попробуйте найти определенную роль или функцию, которую вы хотите, — если этот поиск не возвращает то, что вы ищете, он не включен в серверную ядро.
Например, если вы ищете «Узел сеансов удаленных рабочих столов» — на этой странице его не найти. Это связано с тем, что узел сеансов удаленных рабочих столах не включен в образ ядра сервера.
Помните, что вы всегда можете посмотреть на то, что не включено. Это просто другой способ посмотреть на вещи.
Роли, включенные в серверную ядро
Параметр установки основных серверных компонентов включает следующие роли сервера.
| Роль | Имя | Установлен по умолчанию? |
|---|---|---|
| Службы сертификатов Active Directory | Ad-Certificate | N |
| Доменные службы Active Directory | Доменные службы AD | N |
| службы федерации Active Directory; | ADFS-Federation | N |
| Службы Active Directory облегченного доступа к каталогам | ADLDS | N |
| Службы управления правами Active Directory | AD RMS | N |
| Подтверждение работоспособности устройства | DeviceHealthAttestationService | N |
| DHCP-сервер | DHCP | N |
| DNS-сервер | DNS | N |
| Файловые службы и службы хранилища | FileAnd служба хранилища-Services | Y |
| Служба защиты узла | HostGuardianServiceRole | N |
| Hyper-V | Hyper-V | N |
| Службы печати и документов | Службы печати | N |
| Удаленный доступ | RemoteAccess | N |
| Службы удаленного рабочего стола | Службы remote-Desktop-Services | N |
| Службы активации корпоративных лицензий | VolumeActivation | N |
| Веб-сервер IIS | Веб-сервер | N |
| Режим Windows Server Essentials | ServerEssentialsRole | N |
| Службы обновления Windows Server | UpdateServices | N |
Службы ролей, включенные в серверную ядро
Параметр установки основных серверных компонентов включает следующие службы ролей.
| Роль | Служба роли | Имя | Установлен по умолчанию? |
|---|---|---|---|
| Службы сертификатов Active Directory | Центр сертификации | ADCS-Cert-Authority | N |
| Веб-служба политик регистрации сертификатов | ADCS-Enroll-Web-Pol | N | |
| Веб-служба регистрации сертификатов | ADCS-Enroll-Web-Svc | N | |
| Служба регистрации в центре сертификации через Интернет | ADCS-Web-Enrollment | N | |
| Служба подачи заявок на сетевые устройства | ADCS-Device-Enrollment | N | |
| Сетевой ответчик | ADCS-Online-Cert | N | |
| Active Directory Rights Management | Сервер управления правами Active Directory | ADRMS-Server | N |
| Поддержка федерации удостоверений | ADRMS-Identity | N | |
| Файловые службы и службы хранилища | Файловые службы и службы iSCSI | Файловые службы | N |
| Файловый сервер | FS-FileServer | N | |
| Служба BranchCache для сетевых файлов | FS-BranchCache | N | |
| Дедупликация данных | Дедупликация FS-Data-Deduplication | N | |
| Пространства имен DFS | Пространство имен FS-DFS-Namespace | N | |
| DFS Replication | Репликация FS-DFS | N | |
| Диспетчер ресурсов файлового сервера | FS-Resource-Manager | N | |
| Служба агента VSS файлового сервера | FS-VSS-Agent | N | |
| Целевой сервер iSCSI | iSCSITarget-Server | N | |
| Поставщик служба хранилища iSCSI (поставщики оборудования VDS и VSS) | iSCSITarget-VSS-VDS | N | |
| Сервер для NFS | FS-NFS-Service | N | |
| Рабочие папки | FS-SyncShareService | N | |
| Службы хранения | служба хранилища-Services | Y | |
| Службы печати и документов | Сервер печати | Сервер печати | N |
| Служба LPD | Print-LPD-Service | N | |
| Удаленный доступ | DirectAccess и VPN (RAS) | DirectAccess-VPN | N |
| Маршрутизация | Маршрутизация | N | |
| Прокси-сервер веб-приложения | Веб-приложение-прокси | N | |
| Службы удаленного рабочего стола | Брокер Подключение удаленного рабочего стола* | RDS-Подключение ion-Broker | N |
| Лицензирование удаленных рабочих столов | Лицензирование RDS | N | |
| Узел виртуализации удаленных рабочих столов | Виртуализация RDS-Virtualization | N | |
| Веб-сервер (IIS) | веб-сервер | Веб-веб-сервер | N |
| Основные возможности HTTP | Web-Common-Http | N | |
| Документ по умолчанию | Web-Default-Doc | N | |
| Просмотр каталога | Просмотр веб-Dir- | N | |
| Ошибки HTTP | Ошибки Web-Http | N | |
| Статическое содержимое | Веб-статический контент | N | |
| Перенаправление HTTP | Веб-http-redirect | N | |
| Публикация WebDAV | Веб-DAV-Publishing | N | |
| Работоспособность и диагностика | Веб-работоспособности | N | |
| Ведение журнала HTTP | Ведение журнала веб-http | N | |
| Настраиваемое ведение журнала | Ведение веб-пользовательских журналов | N | |
| Средства ведения журнала | Библиотеки веб-журналов | N | |
| Ведение журнала ODBC | Ведение журнала web-ODBC | N | |
| Монитор запросов | Веб-запрос-Monitor | N | |
| Трассировка | Веб-http-трассировка | N | |
| Производительность | Производительность веб-приложений | N | |
| Сжатие статического содержимого | Веб-Stat-Compression | N | |
| Функция сжатия динамического содержимого | Веб-Dyn-Compression | N | |
| Безопасность | Веб-безопасность | N | |
| Фильтрация запросов | Фильтрация веб-сайтов | N | |
| Обычная аутентификация | Web-Basic-Auth | N | |
| Централизованная поддержка SSL-сертификатов | Web-CertProvider | N | |
| Проверка подлинности с сопоставлением сертификата клиента | Web-Client-Auth | N | |
| Дайджест-проверка подлинности | Веб-дайджест-аутентификация | N | |
| Аутентификация IIS с сопоставлением сертификата клиента | Web-Cert-Auth | N | |
| Ограничения IP-адресов и доменов | Безопасность веб-IP-адресов | N | |
| Авторизация URL-адресов | Веб-URL-проверка подлинности | N | |
| Проверка подлинности Windows | Веб-Windows-Auth | N | |
| Разработка приложений | Web-App-Dev | N | |
| Расширяемость платформы .NET версии 3.5 | Web-Net-Ext | N | |
| Расширяемость .NET 4.6 | Web-Net-Ext45 | N | |
| Инициализация приложения | Web-AppInit | N | |
| ASP | Веб-ASP | N | |
| ASP.NET 3.5 | Web-Asp-Net | N | |
| ASP.NET 4.6 | Web-Asp-Net45 | N | |
| CGI | Web-CGI | N | |
| Расширения ISAPI | Web-ISAPI-Ext | N | |
| Фильтры ISAPI | Web-ISAPI-Filter | N | |
| Включения на стороне сервера | Веб-включает в себя | N | |
| Протокол WebSocket | Web-WebSockets | N | |
| FTP-сервер | Web-Ftp-Server | N | |
| Служба FTP | Веб-ftp-service | N | |
| Расширяемость FTP | Web-Ftp-Ext | N | |
| Средства управления | Web-Mgmt-Tools | N | |
| Совместимость управления IIS 6 | Web-Mgmt-Compat | N | |
| Совместимость метабазы IIS 6 | Веб-метабаза | N | |
| Инструменты для работы со сценариев IIS 6 | Web-Lgcy-Scripting | N | |
| Совместимость WMI IIS 6 | Веб-WMI | N | |
| Сценарии и средства управления IIS | Средства веб-скриптов | N | |
| Служба управления | Web-Mgmt-Service | N | |
| Службы обновления Windows Server | Подключение тивность WID | UpdateServices-WidDB | N |
| Службы WSUS | UpdateServices-Services | N | |
| Подключение тивность SQL Server | UpdateServices-DB | N |
Функции, включенные в серверные ядра
Параметр установки основных серверных компонентов включает следующие функции.
| Компонент | Имя | Установлен по умолчанию? |
|---|---|---|
| Компоненты платформы .NET Framework 3.5. | Функции NET-Framework | N |
| .NET Framework 3.5 (включая .NET 2.0 и 3.0) | NET-Framework-Core | (удалено) |
| Активация по HTTP | NET-HTTP-Activation | N |
| Активация по отличным от HTTP протоколам | NET-Non-HTTP-Activ | N |
| функции платформа .NET Framework 4.6 | Net-Framework-45-Features | Y |
| .NET Framework 4.6 | NET-Framework-45-Core | Y |
| ASP.NET 4.6 | NET-Framework-45-ASPNET | N |
| Службы WCF | NET-WCF-Services45 | Y |
| Активация по HTTP | NET-WCF-HTTP-Activation45 | N |
| Активация по очереди сообщений (MSMQ) | NET-WCF-MSMQ-Activation45 | N |
| Активация по именованному каналу | NET-WCF-Pipe-Activation45 | N |
| Активация по TCP | NET-WCF-TCP-Activation45 | N |
| Совместное использование TCP-портов | NET-WCF-TCP-PortSharing45 | Y |
| Фоновая интеллектуальная служба передачи (BITS) | BITS | N |
| Облегченный сервер загрузки | BITS-Compact-Server | N |
| Шифрование диска BitLocker | BitLocker | N |
| BranchCache | BranchCache | N |
| Клиент для NFS | NFS-Client | N |
| Контейнеры | Контейнеры | N |
| Data Center Bridging | Подключение к центру обработки данных | N |
| Enhanced Storage | Расширенные служба хранилища | N |
| Отказоустойчивая кластеризация | Отказоустойчивая кластеризация | N |
| Управление групповой политикой | Консоль управления групповыми политиками | N |
| Качество операций ввода-вывода | DiskIo-QoS | N |
| Ведущий базовый веб-экземпляр IIS | Веб-WHC | N |
| Сервер управления IP-адресами (IPAM) | База данных | N |
| Служба сервера iSNS | ISNS | N |
| Расширение IIS для управления OData | ManagementOdata | N |
| Media Foundation | Server-Media-Foundation | N |
| служба очередей сообщений | MSMQ | N |
| Службы очереди сообщений | СЛУЖБЫ MSMQ-Services | N |
| Сервер очереди сообщений | MSMQ-Server | N |
| Интеграция служб каталогов | MSMQ-Directory | N |
| Поддержка HTTP | MSMQ-HTTP-Support | N |
| Триггеры очереди сообщений | Триггеры MSMQ | N |
| Служба маршрутизации | Маршрутизация MSMQ | N |
| DCOM-прокси очереди сообщений | MSMQ-DCOM | N |
| Multipath I/O; | Многопатоковые операции ввода-вывода | N |
| Соединитель MultiPoint | MultiPoint-Подключение or | N |
| Службы Подключение MultiPoint | MultiPoint-Подключение or-Services | N |
| Панель мониторинга MultiPoint Manager и MultiPoint | MultiPoint-Tools | N |
| Балансировка сетевой нагрузки | NLB | N |
| протокол PNRP; | PNRP | N |
| qWave; | qWave | N |
| удаленное разностное сжатие; | RDC | N |
| Средства удаленного администрирования сервера | RSAT | N |
| Средства администрирования компонентов | RSAT-Feature-Tools | N |
| программы администрирования шифрования диска BitLocker | RSAT-Feature-Tools-BitLocker | N |
| Средства LLDP dataCenterBridging | RSAT-DataCenterBridging-LLDP-Tools | N |
| средства отказоустойчивости кластеров | Кластеризация RSAT | N |
| Модуль отказоустойчивого кластера для Windows PowerShell | RSAT-Clustering-PowerShell | N |
| Сервер автоматизации отказоустойчивого кластера | RSAT-Clustering-AutomationServer | N |
| Командный интерфейс отказоустойчивого кластера | RSAT-Clustering-CmdInterface | N |
| клиент управление IP-адресами (IPAM) | IpAM-Client-Feature | N |
| Средства для экранированной виртуальной машины | RSAT-Shielded-VM-Tools | N |
| Модуль реплики хранилища для Windows PowerShell | RSAT-служба хранилища-реплика | N |
| Средства Администратор istration | RSAT-Role-Tools | N |
| Средства AD DS и AD LDS | RSAT-AD-Tools | N |
| Модуль Active Directory для Windows PowerShell | RSAT-AD-PowerShell | N |
| Средства AD DS | RSAT-ADDS | N |
| Центр администрирования Active Directory | RSAT-AD-Администратор Center | N |
| Оснастки AD DS и средства командной строки | RSAT-ADDS-Tools | N |
| Оснастки AD LDS и средства командной строки | RSAT-ADLDS | N |
| Средства управления Hyper-V | Средства RSAT-Hyper-V | N |
| Модуль Hyper-V для Windows PowerShell | Hyper-V-PowerShell | N |
| Средства служб Windows Server Update Services | UpdateServices-RSAT | N |
| Командлеты API и PowerShell | UpdateServices-API | N |
| средства DHCP-сервера | RSAT-DHCP | N |
| средства DNS-сервера | RSAT-DNS-Server | N |
| Средства управления удаленным доступом | RSAT-RemoteAccess | N |
| модуль удаленного доступа для Windows PowerShell. | RSAT-RemoteAccess-PowerShell | N |
| RPC через HTTP-прокси; | RPC-over-HTTP-Proxy | N |
| Сбор событий установки и загрузки | Setup-and-Boot-Event-Collection | N |
| простые службы TCP/IP; | Simple-TCPIP | N |
| Поддержка общего доступа к файлам в SMB 1.0/CIFS | FS-S МБ 1 | Y |
| Ограничение пропускной способности S МБ | FS-S МБ BW | N |
| служба SNMP; | SNMP-Service | N |
| Поставщик WMI SNMP | SNMP-WMI-Provider | N |
| Клиент Telnet | Telnet-Client | N |
| Средства экранирования виртуальных машин для управления Fabric | FabricShieldedTools | N |
| Функции Защитника Windows | Компоненты Защитника Windows | Y |
| Защитник Windows | Защитник Windows | Y |
| Внутренняя база данных Windows | Внутренняя база данных Windows | N |
| Windows PowerShell | PowerShellRoot | Y |
| Windows PowerShell 5.1 | PowerShell | Y |
| Подсистема Windows PowerShell 2.0 | PowerShell-V2 | (удалено) |
| Служба настройки нужного состояния Windows PowerShell | Служба DSC | N |
| Windows PowerShell Web Access | WindowsPowerShellWebAccess | N |
| Служба активации Windows | WAS | N |
| Модель процесса | МОДЕЛЬ WAS-Process-Model | N |
| Среда .NET 3.5 | СРЕДА WAS-NET-Environment | N |
| API-интерфейсы конфигурации | API-интерфейсы WAS-Config-API | N |
| Архивация данных Windows Server | Windows-Server-Backup | N |
| Средства миграции Windows Server | Миграция | N |
| Стандартизированное управление хранилищами Windows | Windows служба хранилища ManagementService | N |
| Расширение IIS WinRM | WinRM-IIS-Ext | N |
| WINS-сервер | WINS | N |
| Поддержка WoW64 | WoW64-Support | Y |
*Службы, указанные с помощью *, больше не доступны в ядре сервера, начиная с Server 2019 1803.
index
FSTA публикуется IFIS (International Food Information Service) и широко освещает фундаментальные и прикладные исследования в области науки о продуктах питания, технологии пищевых продуктов и их употреблении. FSTA полностью охватывает цикл производства продуктов питания, начиная с первоначального маркетингового исследования до окончательной упаковки.
Исходные публикации включают информацию из журналов, книг, материалов конференций, отчетов, диссертаций, патентов, стандартов и законодательной документации.
index
Новые функции и заявления
Открытый доступ
Статус открытого доступа предоставляется на платформе Web of Science благодаря сотрудничеству с некоммерческой организацией Our Research, которая недавно запустила базу знаний контента, находящегося в открытом доступе. Эта база знаний позволяет находить и устанавливать связь законного контента, находящегося в открытом доступе, со статусом Gold или Bronze (бесплатный контент на сайте издателя) и Green (например, автор самостоятельно архивирует в репозитарии). Это сотрудничество позволяет повысить результативность поиска и оптимизировать работу со статьями, предоставляемыми в открытом доступе, не только с помощью предоставления дополнительных ссылок, но и отображения их в порядке приоритета по качеству версии данного контента, когда доступны несколько версий статьи. По вопросам повторного использования или заявок на лицензию всегда обращайтесь к владельцу авторских прав. Дополнительные сведения о контенте, предлагаемом в открытом доступе на Web of Science, можно просмотреть на сайте http://info.clarivate.com/openaccess.
Документу может быть присвоен один из следующих статусов открытого доступа:
Тип открытого доступа
Gold
DOAJ
Статьи, опубликованные в журналах, которые входят в каталог журналов в открытом доступе (DOAJ). В соответствии с Будапештской инициативой открытого доступа, обязательным условием внесения в каталог DOAJ является наличие лицензий на все статьи в этих журналах. Обратитесь к DOAJ, чтобы подробнее узнать о конкретных определениях.
Обратитесь к владельцу авторских прав по вопросам повторного использования или заявок на лицензии.
Другое
Статьи в открытом доступе с другим статусом Gold — это статьи, имеющие лицензию Creative Commons (CC), согласно данным базе данных Our Research Unpaywall Database, но не опубликованные в журналах, указанных в каталоге DOAJ.
Большинство из этих статей опубликовано в гибридных журналах. Гибридные журналы в открытом доступе представляют собой журналы, распространяемые по подписке, которые содержат некоторые статьи в открытом доступе.
Следует иметь в виду, что обозначение «Другой статус Gold» является индикатором статей в открытом доступе со статусом Hybrid Gold, имеющих различные готовности, особенно для новых публикаций.
Обратитесь к владельцу авторских прав по вопросам повторного использования или заявок на лицензии.
Bronze
Лицензирование этих статей либо нечеткое, либо в соответствии с данными в базе данных Our Research Unpaywall Database, эти статьи определены как не имеющие лицензии CC. Это статьи находятся в открытом доступе на сайте издателя или предоставляются для прочтения бесплатно.
Издатель может в качестве рекламной акции предоставлять доступ к статье на ограниченное время. В конце периода проведения акции доступ к статье может предоставляться за плату, в результате в наших данных могут временно возникать ошибки.
Следует иметь в виду, что некоторые материалы могут быть неполными, особенно новые материалы.
Обратитесь к владельцу авторских прав по вопросам повторного использования или заявок на лицензии.
Green
Опубликовано
Финальные опубликованные версии статей, хранящиеся в репозитарии организации или в тематическом репозитарии (например, статья, опубликованная на портале PubMed Central с закончившимся периодом запрета).
Обратитесь к владельцу авторских прав по вопросам повторного использования или заявок на лицензии.
Принято
Принятые неопубликованные работы, хранящиеся в репозитарии. Содержимое прошло экспертную оценку и является финальной версией, но при этом, возможно, еще не прошло корректуру или набор в издательстве.
Обратитесь к владельцу авторских прав по вопросам повторного использования или заявок на лицензии.
Основное преимущество сотрудничества с Our Research состоит в возможности определения приоритета ссылок для открытого доступа так, чтобы пользователь сначала видел версию записи на сайте издателя, затем окончательную версию и только потом принятую неопубликованную работу в репозитарии. Предоставляется только одна ссылка для открытого доступа.
Пользователи могут уточнить результаты поиска, чтобы найти статьи в открытом доступе и прочитать их независимо от элементов хранения библиотеки.
Следующие статусы открытого доступа доступны как часть экспорта полной записи
- DOAJ Gold:
- Другой статус Gold:
- Bronze:
- Опубликованные со статусом Green
- Принятые со статусом Green
Уточнение результатов для открытого доступа
Панель «Уточнение результатов» в Web of Science предлагает два метода фильтрации результатов поиска, позволяющих отобразить только контент с открытым доступом.
- С использованием фильтра Открытый доступ в основной панели Фильтровать результаты в верхней левой части страницы Сводка результатов поиска позволяет отобразить в результатах только статьи с открытым доступом любого типа.
- В панели Уточнение результатов слева можно уточнить тип открытого доступа:
- DOAJ Gold
- Другой статус Gold
- Bronze
- Опубликованные со статусом Green
- Принятые со статусом Green
Изменения в области анализа результатов
Внедрен новый интуитивный визуальный анализ, который позволяет легко и быстро отслеживать тенденции в больших наборах данных. Пользователи могут управлять визуализацией: отображать более или менее подробную информацию о наборе данных, или изменять стиль визуализации. Чтобы подробнее узнать о данных, пользователи могут просмотреть интересующие записи, выбрав их на виде визуализации. По завершении пользователи могут экспортировать визуализацию, чтобы показать влияние предоставления или покупки приложения.
Поиск данных исследований
С данными исследований теперь можно ознакомиться в Web of Science! Исследователи могут искать статьи по интересующей их теме в Web of Science Core Collection, фильтровать результаты для поиска данных, которые разрешено копировать и повторно использовать, чтобы создавать новые труды, опираясь на ранее опубликованные результаты. Просто щелкните «Связанные данные» в панели «Уточнение результатов». Примечание. Доступно только для подписчиков, имеющих доступ к Data Citation Index.
index
Платформа Web of Science
Указатели цитирования
- Web of Science Core Collection
- Arabic Citation Index
- BIOSIS Citation Index
- Справка по базе данных цитируемости в китайских научных изданиях SM
- Data Citation Index
- Russian Science Citation Index
- SciELO Citation Index
Базы данных продуктов
- Biological Abstracts
- BIOSIS Previews
- Current Contents Connect
- CABI: CAB Abstracts and Global Health ®
- FSTA ® — справочный ресурс о науке о продуктах питания
- Inspec ®
- KJD-База данных журналов Кореи
- MEDLINE ®
- Zoological Records
Derwent Innovations Index
Можно просматривать записи в Derwent Innovations Index с помощью новой платформы и интерфейса пользователя, но этот конкретный продукт запускается только с использованием собственного механизма поиска.
index
Системные требования
Следующие версии операционных систем и браузера полностью протестированы при использовании новейшей версии платформы Web of Science.
Операционные системы и браузеры Windows®
- Windows 7 (рекомендуется)
- Windows 10
- Internet Explorer 11 (полная поддержка)
- Firefox 54 (полная поддержка)
- Chrome 59 (полная поддержка)
Операционные системы и браузеры Macintosh®
- Windows 10.9 (рекомендуется)
- Safari 11.1.1
- Safari 10.X (рекомендуется)
- Firefox 54 (полная поддержка)
Windows 7 является единственной из поддерживаемых операционных систем, которая совместима с Internet Explorer 11. Бета-версии любых веб-браузеров не поддерживаются.
index
Требования JavaScript
JavaScript – это язык сценариев, позволяющий сделать веб-страницы интерактивными. Чтобы платформа Web of Science работала правильно, в веб-браузере необходимо включить JavaScript.
index
Вопросы, относящиеся к системе
В этом разделе рассматриваются вопросы, относящиеся к системе, и способы устранения возникающих проблем.
index
Изменить настройки: Подсказывать названия изданий при наборе (Предупреждение)
При выборе китайского языка как языка поиска для параметра Все базы данных или База данных цитируемости в китайских научных изданиях автоматически отключается функция автоматических подсказок для всех баз данных продуктов в Web of Science. Параметр ВЫКЛ. отображается в окне «Автоматически предлагать названия публикаций» для всех продуктов.
Чтобы снова включить функцию автоматических подсказок, следует сначала выбрать английский язык или автоматический выбор языка поиска для параметра «Изменить настройки». Далее следует включить функцию автоматических подсказок. После этого параметр ВКЛ. будет отображаться в окне функции автоматических подсказок для всех баз данных продуктов.
Можно выбрать Web of Science Core Collection и других базы данных продуктов и вручную включить функцию автоматических подсказок.
index
Добавление записей в учетную запись EndNote
Чтобы использовать эту функцию, необходимо быть зарегистрированным пользователем Web of Science и нужно войти в программу.
Если вход не произведен, после выбора записей, которые необходимо добавить в учетную запись EndNote, и нажатия ссылки EndNote система отобразит запрос на вход. После этого система выполнит возврат на страницу «Результаты» или «Полная запись», на которой необходимо выполнить повторную отправку записей в библиотеку EndNote.
index
Авторское право
Clarivate, названия продуктов и сокращения, используемые в этом документе, являются товарными знаками, зарегистрированными товарными знаками и знаками обслуживания, используемыми по лицензии. Clarivate Analytics не обладает правом собственности на знаки и названия других компаний.
- Microsoft ® является зарегистрированным товарным знаком компании Microsoft Corporation.
- Macintosh ® является зарегистрированным товарным знаком компании Apple, Inc.
Эти и другие названия продуктов, упоминаемые в этом документе, являются зарегистрированными товарными знаками соответствующих владельцев.
Платформа Web of Science определяет состояние открытого доступа на уровне журнала из нескольких источников, включая метаданные, предоставляемые непосредственно издателями и каталогом журналов, находящихся в открытом доступе (DOAJ). Метаданные из каталога DOAJ используются по лицензии Creative Commons Attribution-ShareAlike (CC-BY-SA).
index
Глобальная служба поддержки пользователей
Если есть вопросы по продуктам, обратитесь в Центр глобальной службы поддержки пользователей. Представители службы технической поддержки могут ответить на вопросы о данных, а также на все вопросы о выполнении поиска и поисковых механизмах. Вопросы по поводу сетевых подключений и/или использованию веб-браузера необходимо направлять вашему администратору сети.
index
Другие ресурсы
- Для просмотра записей наших руководств перейдите на веб-страницу Записи занятий.
- Чтобы оставить отзыв о дизайне Web of Science или о возникших проблемах, заполните форму отзыва Web of Science.
| © Clarivate, 2020 | © 2020 International Food Information Service (IFIS Publishing) operating as IFIS | Дата последнего изменения: 03/15/2020 |
Методические рекомендации по стандартизации данных для публикации через глобальный портал gbif. Org и подготовке статьи о данных Текст научной статьи по специальности «Компьютерные и информационные науки»
Аннотация научной статьи по компьютерным и информационным наукам, автор научной работы — Шашков М. П., Чадин И. Ф., Иванова Н. В.
Обсуждены основные принципы и процедура публикации данных через GBIF.org, приводятся рекомендации по использованию стандарта Darwin Core и оценке качества данных. Впервые на русском языке описан опыт публикации статьи о данных.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
Похожие темы научных работ по компьютерным и информационным наукам , автор научной работы — Шашков М. П., Чадин И. Ф., Иванова Н. В.
Публикация коллекции Сочинского «Дендрария» в GBIF
Глобальные данные о биоразнообразии Алтайской горной страны, представленные в мировых научных депозитариях
О i международной научно-практической конференции «Использование современных информационных технологий в ботанических исследованиях
Дополнения к флоре европейской части России
Состояние популяций охраняемого лишайника Lobaria pulmonaria в заповеднике «Кологривский лес» (Костромская область)
i Не можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
i Надоели баннеры? Вы всегда можете отключить рекламу.
The basic principles and procedure for datasets publishing through GBIF.org are discussed. Recommendations on the use of Darwin Core standard and data quality assessment are given. The experience of data paper publishing is described for first time in Russian.
Текст научной работы на тему «Методические рекомендации по стандартизации данных для публикации через глобальный портал gbif. Org и подготовке статьи о данных»
М. П. Шашков1’2, И. Ф. Чадин3, Н. В. Иванова1
Институт математических проблем биологии РАН — филиал Федерального государственного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт прикладной математики им. М. В. Келдыша РАН»
2 Институт физико-химических и биологических проблем почвоведения РАН
3 Институт биологии Коми НЦ Уральского отделения РАН
МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ ПО СТАНДАРТИЗАЦИИ ДАННЫХ ДЛЯ ПУБЛИКАЦИИ ЧЕРЕЗ ГЛОБАЛЬНЫЙ ПОРТАЛ GBIF.ORG И ПОДГОТОВКЕ СТАТЬИ О ДАННЫХ
Обсуждены основные принципы и процедура публикации данных через GBIF.org, приводятся рекомендации по использованию стандарта Darwin Core и оценке качества данных. Впервые на русском языке описан опыт публикации статьи о данных.
биоразнообразие, открытые данные, стандарт Darwin Core, качество данных, геопривязка.
M. P. Shashkov, I. F. Chadin, N. V. Ivanova
GUIDE TO BEST PRACTICES ON A DATA STANDARDIZATION FOR PUBLICATION VIA THE GLOBAL PORTAL GBIF.ORG AND PREPARING DATA PAPER
The basic principles and procedure for datasets publishing through GBIF.org are discussed. Recommendations on the use of Darwin Core standard and data quality assessment are given. The experience of data paper publishing is described for first time in Russian.
biodiversity, open data, Darwin Core standard, data quality, georeference Введение
Интеграция данных о находках биологических видов является актуальной задачей в области изучения биоразнообразия. Конвенция о Биологическом разнообразии (1992), ратифицированная Россией в 1995 г., а также Айтинские целевые задачи (2010) предполагают совместное использование данных о биоразнообразии странами-участницами конвенции, а также развитие научной базы и технологий, связанных с оценкой биологических ресурсов.
В настоящее время существует несколько крупных международных систем, объединяющих данные о биоразнообразии, крупнейшей из которых является Глобальная Информационная Система по Биоразнообразию GBIF (gbif.org), созданная в 2001 году на основе межправительственных соглашений как научная инфраструктура, обобщающая данные биологических коллекций. Структура GBIF представляет собой сеть взаимосвязанных национальных «узлов» (Nodes) стран-участниц, крупных международных организаций и отдельных институтов в странах, не являющихся официальными участниками
GBIF. На момент подготовки этой статьи 1064 организации (Data Publishers) через GBIF.org опубликовали 35885 наборов данных (Datasets), со сведениями о 797353488 находках (Occurrences) 1727442 видов. Все данные, опубликованные через GBIF.org, являются открытыми, т. е. доступны для загрузки любому зарегистрированному на портале пользователю.
Потребность «открытия» информации, т. е. публикации первичных данных все более осознается мировым научным сообществом. Постоянно растущий объем «открытых» данных способствует повышению качества исследований, электронная публикация через глобальные порталы позволяет демонстрировать использование и цитирование данных, увеличивает их потенциал для повторного использования в междисциплинарных исследованиях в составе объединенных массивов (Penev et al., 2017).
Информация, опубликованная в электронном виде, также позволяет опубликовать описание набора данных в виде отдельной научной статьи — т.н. статьи о данных (Data paper). Согласно концепции, предложенной в работе V. Chavan и L. Penev (2011), статья о данных — это особый вид публикации в рецензируемых научных журналах, основной целью которой является не анализ результатов исследований, а подробное описание набора (наборов) данных. В отличие от классической научной статьи она содержит факты о данных и их описание, информацию о методах сбора и др., но не о гипотезах и результатах их проверки, которые были получены с использованием этих данных. Такие публикации дают возможность научному сообществу ссылаться в привычной форме на работы коллег, обеспечивают структурированное описание информации и доводят до широкой научной общественности факт ее существования. В настоящее время такие статьи публикуются в 27 международных журналах, в т. ч. индексированных в реферативных базах данных публикаций (Data. 2017).
В России процесс «открытия» национальных данных о биоразнообразии и их интеграции в международные проекты находится на начальном этапе. Большинство российских ресурсов о биоразнообразии до настоящего времени остаются закрытыми (Иванова, Шашков, 2014), существует лишь несколько открытых тематических информационных систем. Наиболее успешными среди них являются электронный портал гербария МГУ им. М. В. Ломоносова (Seregin, 2016), информационная система по биоразнообразию криптогамных организмов CRIS (Мелехин и др., 2013) и краудсорсинговая информационная система «Фаунистика», объединяющая данные о находках хищных птиц (Веб-ГИС «Фаунистика», 2012). Число российских научных и природоохранных организаций-участников GBIF за предыдущие три года возросло от двух до одиннадцати, был опубликован 21 набор данных (более 140 тыс. находок видов), в 2017 г. опубликована первая российская статья о данных (Chadin et al., 2017). Все это свидетельствует о заинтересованности российского научного сообщества в «открытии» данных и их публикации через международные порталы. В то же время, имеет место ряд технических препятствий. Электронная публикация через GBIF.org осуществляется на основе единого стандарта описания и представления информации. Это облегчает обмен данными между разными ресурсами и позволяет полностью сохранить сведения о находках видов и их правообладателях. Однако в России международные стандарты для описания данных о биоразнообразии используются редко, а национальные стандарты отсутствуют (Иванова, Шашков, 2014), поэтому возникает
необходимость предварительной обработки и форматирования данных (т. е. приведения их к соответствующему стандарту). Имеющийся у авторов опыт проведения в России практических семинаров по работе с GBIF.org показывает, что англоязычных руководств, доступных через глобальный портал (Create. 2011 и др.), и кратких инструкций на неофициальном русскоязычном сайте GBIF (gbif.ru) недостаточно для подготовки набора данных к публикации.
В работе описывается общая схема публикации через GBIF.org и приводятся рекомендации по стандартизации данных для их мобилизации через глобальный портал и подготовке статьи о данных.
Основные принципы публикации данных через GBIF.org
Большая часть данных, опубликованных через GBIF.org, соответствует единому стандарту Darwin Core, сокращенно DwC (Wieczorek et al., 2012), используются также стандарты ABCD (Access., 2015) и EML (Ecological., 2017). Для приведения информации к DwC и публикации через GBIF.org необходим специальный онлайн инструмент Integrated Publishing Toolkit, IPT (Robertson et al., 2014).
Объединение данных в GBIF происходит на основе таксономической системы Backbone Taxonomy (GBIF Backbone., 2016), которая представляет собой синтез из многих таксономических баз данных, а также некоторых списков видов, опубликованных через GBIF.org. Крупнейшей таксономической базой в ее составе является Catalogue of Life, CoL (2015), содержащий более 3 млн таксонов или около 60% всех данных Backbone. Для каждого таксона могут быть указаны синонимы, а также названия на национальных языках. Важно отметить, что в настоящее время многие российские эндемичные виды отсутствуют в Backbone, поэтому при публикации данных о находках таких видов их таксономическое положение будет автоматически указано до ближайшего известного таксона более высокого ранга. Для внесения новых видов в Backbone необходимо сначала опубликовать список, содержащий новые для системы виды (Checklist Data, см. ниже), после чего связаться с Секретариатом с просьбой включения этого списка в набор ресурсов, из которых формируется Backbone. В случае, если он будет включён в новую версию системы, то названия таксонов ранее опубликованных находок будут актуализированы с учетом обновлений Backbone. Отметим, что обновления происходят довольно редко (2-4 раза в год).
Публикацию через глобальный портал осуществляют только зарегистрированные в GBIF организации, которые принимают решение об объеме и подробности публикуемых данных, контролируют их качество, а также имеют возможность отозвать любой из опубликованных ими наборов данных (Costello, 2009). Публикующая организация устанавливает однозначные правила повторного использования информации, которые должны быть понятны потенциальным пользователям. Для описания этих правил существуют различные лицензии (Penev et al., 2017). Секретариат GBIF рекомендует использовать открытые лицензии сообщества Creative Commons (О лицензиях., 2017), которые позволяют авторам и правообладателям данных объявить об отсутствии ограничений на их использование (CC0), указать необходимость цитирования источника (CC-BY), или заявить о запрете их коммерческого использования (CC-BY-NC).
Каждый набор данных, опубликованный через GBIF.org, получает уникальный идентификатор цифрового объекта (DOI) и имеет постоянную вебстраницу на глобальном портале. Все данные однозначно указывают на организацию, от имени которой они опубликованы и роли лиц, причастных к публикации. Также автоматически формируется ссылка для цитирования данных, в которую включаются как авторы самих данных, так и метаданных. Авторы и представители организации могут отслеживать использование данных по списку публикаций, в которых часть или весь набор данных цитируются с указанием DOI. Тем не менее, механизм контроля за соблюдением пользователями правил использования и цитирования данных, доступных через GBIF.org, отсутствует, т. е. случаи плагиата и несоблюдения лицензионных требований теоретически возможны. Очевидно, что такая ситуация может вызывать беспокойство правообладателей и авторов данных. Однако, важно понимать, что корректное использование и цитирование «обычных» литературных источников также находится под контролем цитирующего и, как показывает практика, в большинстве случаев эти правила соблюдаются. Благодаря наличию DOI у каждого набора данных, случаи недобросовестного их использования выявить несложно, также, как и доказать авторство в отношении собственных данных.
Основные этапы публикации данных через GBIF.org
Процедура электронной публикации данных через GBIF.org при помощи IPT состоит из следующих этапов: (1) регистрация организации в GBIF, (2) выбор типа публикации, (3) составление описания набора данных — метаданных, (4) стандартизация набора данных, если публикация не ограничивается метаданными, и (5) собственно публикация набора данных через IPT как технический процесс.
Регистрация организации в GBIF
Публикацию через GBIF.org следует предварительно согласовать с руководителем организации, от имени которой будут опубликованы данные (письменного подтверждения при этом не требуется). Для регистрации новой организации в GBIF, необходимо заполнить специальную веб-форму (Request endorsement), доступную на GBIF.org (Become. 2017), в которой необходимо указать информацию об организации, а также административные и технические контакты. Все поля заполняются на английском языке. Заявка рассматривается Секретариатом, после чего организация одобряется участниками GBIF. Как правило, процедура одобрения (Endorsement) новых участников занимает 1-2 недели. Для каждой организации на портале автоматически создается отдельная веб-страница, где размещается информация о ней и об опубликованных наборах данных. Все данные об организации вносятся на основе информации регистрационной формы, изменить их можно, связавшись с Секретариатом через helpdesk@gbif.org.
Выбор типа публикации
В настоящее время GBIF.org поддерживает публикацию данных, содержащих описания коллекций или тематических электронных ресурсов, таксономические сводки, данные о находках видов (коллекционных образцах), а также результаты площадных и маршрутных учетов и данные мониторинга.
Общая схема организации данных в наборах разных типов с обязательными для заполнения полями представлена на рис. 1, подробное описание приводится ниже.
Рис. 1. Типы данных, доступных через GBIF.org, и обязательные для заполнения поля
1. Метаданные (Meta Data Only), или «данные о данных», предполагают только описание набора данных без предоставления исходных сведений. Наборы метаданных представляют собой ценный источник базовой информации о массивах данных, которые недоступны через Интернет. Публикация метаданных позволяет объявить о существовании того или иного массива данных и сделать его потенциально доступным для научного сообщества.
Например, таким способом можно опубликовать описание коллекции, не имеющей электронного каталога, описать узкоспециализированный тематический ресурс, к которому сложно применить стандарты GBIF, или ресурс, данные которого раскрывать неправомерно, но информация о нем является ценной для специалистов. В первую очередь, это касается сводок о распространении редких и охраняемых видов, а также видов, представители которых имеют коммерческую ценность и могут легко стать объектом браконьерства.
Технические возможности IPT позволяют авторам данных предоставить метаданные в объеме, который они считают необходимым (Resource., 2017). Обязательной информацией являются название, аннотация и указание языка, на котором описаны метаданные, а также имена создателя GBIF-ресурса и автора метаданных. Отметим, что эти функции могут быть определены как для одного, так и для нескольких специалистов. Помимо этого, можно привести ключевые слова, описать географический, таксономический и временной охват данных, методы их сбора, привести список публикаций и проектов, связанных с этими данными. Метаданные рекомендуется приводить на английском языке, хотя публикация метаданных на других языках технически возможна. На сайте GBIF также создана возможность уведомить научное сообщество о существующих неопубликованных данных без использования IPT при помощи веб-инструмента Suggest a dataset (https://gbif.org/suggest-dataset). Остальные типы наборов данных, помимо обязательных метаданных, предполагают публикацию сведений о находках видов или списков видов.
2. Список видов (Checklist Data) предполагает публикацию таксономического списка. Это может быть список видов для определенной территории (Khanina et al., 2016 и др.), таксономический список рода или более крупного таксона, каталог типовых образцов коллекции (Smirnov et al., 2017; Volkovitsh et al., 2017 и др.) и т. д. Поскольку не все образцы могут быть определены с точностью до вида, то помимо названия таксона указывается его ранг. Также наборы данных этого типа могут включать другую дополнительную информацию, например, синонимы, названия видов на национальных языках и др.
3. Данные об отдельных находках (Occurrence Data). Наборы данных этого типа содержат информацию о нахождении того или иного вида в определенном месте в определенное время, т. е. предполагают наличие сведений о дате находки и географической привязке места нахождения вида (или сбора образца). В отличие от следующего типа, данные о находках могут быть не связаны между собой. Эти наборы данных составляют основную часть данных, опубликованных через GBIF.org, и могут происходить из различных источников. В качестве Occurrence Data могут быть представлены как непосредственно данные о полевых находках (включая отдельные наблюдения, полученные с помощью автоматических фото- и видеорегистраторов; для серий наблюдений см. Sampling Event ниже), так и наборы данных, описывающие коллекционные образцы (Melechin, 2016), материалы летописей природы (Seyfulina, Buyvolov, 2016), литературные данные о находках видов, данные тематических ресурсов (Chadin et al., 2016; Shashkov, Ivanova, 2016; Petrosyan, Kuzmin, 2017) и т. д. Существует также возможность опубликовать список видов со связанными с ним Occurrence Data, используя список видов как центральную таблицу (Core).
4. Данные обследований на пробных площадях и мониторинга (Sampling Event Data). Этот тип публикации является относительно новым для
GBIF и позволяет мобилизовать данные, собранные в результате площадных и маршрутных учетов или мониторинговых исследований в виде методологически связанных блоков информации. Кроме информации об отдельных находках, в таких наборах данных приводятся сведения, относящиеся сразу ко многим находкам, например, это могут быть данные о характеристиках сообщества или методы проведения исследований. Также можно описать обилие какого-либо вида на различных участках или его динамику в течение определенного периода времени. Такие данные собираются с применением тех или иных стандартных методов учетов, сборов или наблюдений. Методы сбора данных кратко описываются в соответствующих полях таблицы с исходными данными. Объем проделанных работ можно оценить, указав способ сбора данных (samplingProtocol2), площади учета или протяженность маршрутов (sampleSizeValue и sampleSizeUnit), а также, при необходимости, объем или длительность наблюдений (sampling Effort). В метаданных следует приводить подробное описание методов сбора. Особая ценность подобных данных заключается в возможности сопоставления результатов, полученных одинаковыми методами на разных территориях и / или в разное время (Dataset. 2017).
Стандартизация данных в соответствии Darwin Core
Как было описано выше, данные, публикуемые через GBIF.org, должны соответствовать международным стандартам. Под стандартом мы понимаем набор полей (терминов), описывающих свойства объектов и правила их использования. В настоящее время в GBIF основным является стандарт DwC, разработанный группой Biodiversity Informatics Standards, ранее известной как Taxonomic Databases Working Group (TDWG. 2017).
Для публикации данные необходимо представить в виде электронной таблицы MS Excel или файла CSV, в которых содержание и заголовки полей (столбцов) соответствуют терминам DwC. При подготовке Checklist Data одной записи (строке) в таблице должен соответствовать один таксон, для Occurrence Data — одна находка (одновидовой коллекционный образец). В случае Sampling Event Data необходимо подготовить две таблицы: первая (Sampling Events) содержит описание проб или пробных площадей (одна запись соответствует одной пробной площади, маршруту и т. д.), методов и объемов сборов, а вторая (Associated Occurrences) — список таксонов, обнаруженных на каждой пробной площади и их характеристики (одна запись соответствует одной находке). Метаданные набора данных приводятся в отдельном текстовом файле.
Через веб-сервис github.com для каждого типа наборов данных доступны шаблоны (Checklist. 2017; Occurrence., 2017; Sampling., 2017), которые представляют собой электронные таблицы, содержащие DwC-заголовки полей и примеры их заполнения. Выделены обязательные и рекомендуемые к заполнению поля; приводятся примеры для разных объектов. Также в шаблонах содержатся краткие инструкции по подготовке данных.
При стандартизации набора данных необходимо соблюдать правила использования терминов DwC (Darwin., 2015). Для каждого термина приводится название (Term Name), уникальный идентификатор (Identifier),
2Здесь и далее термины DwC приводятся в оригинальном написании.
категория (Class), содержание термина (Definition), краткие рекомендации по его использованию (Comment) и ссылка на подробное описание (Details). Содержание всех терминов DwC и примеры их использования доступны на сайте TDWG, русскоязычное описание наиболее часто употребительных терминов и примеры их использования — на сайте gbif.ru (Иванова, Шашков, 2017).
Текущая версия DwC содержит около 200 терминов, позволяющих описать данные, полученные из разных источников. Более 30 расширений (extensions) для специфических данных DwC позволяют описывать характеристики отобранных проб, результаты молекулярно-генетического анализа, аудио- и видеоматериалы, и многие другие атрибуты, обычно не применимые к большинству данных, но в определенных областях исследований имеющие большую ценность. С помощью терминов DwC можно описывать данные о локалитетах, где целевые виды не были обнаружены, что важно для решения задач мониторинга популяций охраняемых видов и изучения динамики их ареалов. Очевидно, что для описания каждого образца невозможно использовать абсолютно все термины DwC, некоторые термины вообще являются взаимоисключающими. В то же время, при описании специфических данных часто возникают ситуации, когда терминов DwC не хватает для описания всей атрибутивной информации. В таких случаях рекомендуется вносить такие данные в примечания (см. ниже) или использовать наиболее близкие по смыслу термины с обязательным указанием того, какие именно данные приводятся в соответствующих полях.
Для удобства пользователей термины DwC сгруппированы в несколько тематических разделов. Раздел Record-level Terms используется для описания общих данных об объектах. В нем приводится информация об организации, в которой хранятся данные (образцы) и описываются правила их использования. Если в данных содержится какая-то специфическая атрибутивная информация, которая доступна на стороннем ресурсе и не публикуется через глобальный портал, об этом также стоит указать в этом разделе (термин informationWithheld). В разделе Occurrence приводятся сведения о состоянии организма во время находки или сбора (численность, поведение, жизненное состояние и др.). Время и методы сборов описываются терминами раздела Event | HumanObservation | MachineObservation. В разделе Location можно охарактеризовать географическую привязку места находки. Таксономическое положение вида (образца) описывается в разделе Taxon, а источники, использованные для его определения — в разделе Identification. Описание особенностей конкретного организма или таксономически однородной группы организмов приводится в разделе Organism. Для каждого раздела предусмотрены примечания, которые заносятся в поля Remarks. В них можно приводить любую дополнительную информацию, касающуюся соответствующего раздела.
Концепция DwC предполагает хранение как исходной, так и формализованной информации с описанием методов, которыми эта формализация была выполнена. Для хранения исходной информации используются термины группы verbatim, в буквальном переводе «дословно», (например, verbatimEventDate, verbatimLocality и др.); информация в них должна в точности соответствовать первоисточнику (гербарной этикетке, полевому дневнику, литературной публикации и т.п.). Термины, предназначенные для хранения формализованной информации, предполагают фиксированное значение из словаря или использование определенного стандарта представления данных.
В описании терминов, имеющих словарь, содержится фраза «Recommended best practice is to use a controlled vocabulary», список возможных значений доступен по ссылке в разделе Comment. Например, для термина disposition, описывающего актуальное состояние коллекционного образца, возможны значения «in collection», «missing», «voucher else where», «duplicates else where». Информация о форматах представления данных также приводится в описании терминов. Например, для описания даты и времени используется стандарт ISO 8601:2004(E). Некоторые термины DwC могут содержать перечисление нескольких значений, например, в identificationReferences может быть перечислено несколько источников, использованных для определения таксономического положения объекта. В таких случаях значения рекомендуется отделять друг от друга вертикальной чертой (|). Данные в полях verbatim следует приводить на языке оригинала, а формализованную информацию — желательно на английском языке.
Часто при подготовке данных к публикации возникают трудности при указании названий географических объектов. Проблема заключается в том, что в России отсутствует общепринятый перечень географических названий, а их написание в английской транслитерации в общедоступных картографических сервисах может различаться. В связи с этим, необходимо не только приводить англоязычные названия географических объектов, но и указывать источники, из которых они получены, а также приводить топонимы на языке оригинала. Эти правила касаются также трансформированных географических координат, унифицированных названий видов и др.
Важным этапом стандартизации данных является оценка их качества. Прежде всего, это касается определения точности географических координат места находки того или иного вида. В начале XXI в. исследователям стали широко доступны средства спутниковой навигации, позволяющие фиксировать координаты с точностью до нескольких метров. В течение большей части XX в. координаты, как правило, указывали по топографическим картам общедоступных масштабов 1:200 000 или 1:500 000, вследствие чего точность привязки, в лучшем случае, составляла сотни метров. Для большинства находок в качестве ориентира указывался ближайший географический объект или населенный пункт, а также административная принадлежность территории. При этом за последние 100 лет границы регионов неоднократно менялись, многие населенные пункты были переименованы (некоторые неоднократно) или в настоящее время уже не существуют. Очевидно, что в такой ситуации оценка точности географической привязки находок очень важна, и от нее зависят возможности использования данных для решения тех или иных задач.
Для оценки качества геоданных рекомендуется сначала загрузить координаты точек находок в какую-либо геоинформационную систему (ГИС) и проверить данные на отсутствие грубых ошибок в географической привязке (например, точки, находящиеся в море для сухопутных видов, ошибки привязки из-за замены местами значений широты и долготы, точки с нулевыми координатами и др.). После этого желательно также оценить точность геопривязки, если это не было сделано ранее в процессе сбора или оцифровки данных. Термины DwC позволяют указать точность определения координат с помощью GPS-навигатора в долях градуса (термин coordinatePrecision) или в метрах при определении места находки на основе вербального описания (термин coordinateUncertaintyInMeters). В последнем случае рекомендуется
следовать стандартной методике («точка-радиус»), описанной в соответствующем руководстве (Guide., 2006). Оценка точности привязки может быть выполнена при помощи онлайн-калькулятора (Wieczorek, Wieczorek, 2015). В случае оценки точности привязки другими методами необходимо приводить данные об источниках и описание этих методов в соответствующих полях DwC. Если по какой-то причине точные координаты находок заведомо не приводятся или точность привязки преднамеренно снижается, например, в случаях публикации данных о распространении охраняемых видов, то это также необходимо указывать (термин informationWithheld).
Важно также обратить внимание на технические требования к качеству данных. Не должно быть дубликатных записей (строк) и повторяющихся полей (столбцов). В текстовых данных не допускаются грамматические ошибки, пробелы в начале и конце строки, пробельные символы, не являющиеся пробелом (неразрывный пробел, перевод каретки, разрыв строки, знак табуляции и т. п.). Также рекомендуется изучить отчет об ошибках (interpretation issues), доступный на странице набора данных, и загрузить уже опубликованный набор в формате DwC-A, чтобы оценить, как он выглядит с точки зрения их конечного пользователя.
Публикация данных через IPT
Непосредственно процедура публикации данных через GBIF.org осуществляется с помощью специального программного обеспечения IPT, написанного на языке Java и функционирующего как серверное приложение с визуальным интерфейсом, доступным через браузер. IPT работает под управлением веб-сервера Apache и службы веб-приложений TomCat 7. Изначально IPT имеет англоязычный интерфейс, начиная с версии 2.3.3, вышедшей в начале 2017 г., доступна русскоязычная версия. Все опубликованные данные хранятся непосредственно на сервере с установленным IPT, на глобальном портале размещаются только метаданные. IPT может быть связан с веб-сайтом национального портала, на котором визуализируются опубликованные через эту инсталляцию данные. К одной IPT-инсталляции может быть «привязано» несколько организаций, каждая из которых, в свою очередь, может иметь несколько аккаунтов для сотрудников с разными правами в отношении публикации данных. Для того, чтобы опубликовать подготовленный набор данных нужно установить собственный IPT или воспользоваться уже существующей инсталляцией, связавшись с ее администратором. В настоящее время в России функционируют 4 IPT-инсталляции: в Зоологическом институте РАН (г. Санкт-Петербург, администратор Халиков Р. Г.), Институте математических проблем биологии — филиале ИПМ им. М. В. Келдыша РАН (г. Пущино, администратор Шашков М. П.), Институте биологии Коми научного центра УрО РАН (г. Сыктывкар, администратор Чадин И. Ф.) и в Институте растениеводства им. Н. И. Вавилова РАН (г. Санкт-Петербург, администратор Лоскутов И. Г.).
Для публикации необходимо загрузить в IPT электронную таблицу с данными, проверить их на соответствие DwC и разместить метаданные. После окончания технической части публикации (нажатия кнопки Register) набор данных индексируется в глобальной системе и в течение нескольких часов становится доступным через портал GBIF.org.
Подготовка и публикация статьи о данных
Как было описано выше, статья о данных представляет собой подробное описание массива, опубликованного через какой-либо тематический электронный портал. Как и в случае «обычной» исследовательской статьи, структура рукописи должна соответствовать определенным критериям, которые описаны в правилах для авторов. Рукописи проходят обязательное рецензирование. Важно учитывать, что издатели статей о данных оставляют за собой право принимать к публикации рукописи, содержащие описание только «значимых для науки» данных, в то время как открытые порталы (GBIF.org и др.) не накладывают никаких ограничений на объем, географический и временной охват публикуемой информации. В процессе публикации набора данных важно следить, чтобы все необходимые поля метаданных были заполнены, а текст метаданных соответствовал общепринятому стилю изложения научной информации на английском языке.
Рассмотрим особенности подготовки статьи о данных в журналы издательства Pensoft Publishers (https://pensoft.net), одним из основателей которого является автор концепции data paper Любомир Пенев. В первую очередь, необходимо обратить особое внимание на лицензию, которую автор может присвоить своему набору данных. Pensoft Publishers, в отличие от GBIF, не позволяет использовать лицензии, ограничивающие коммерческое использование данных (CC-BY-NC). Подготовка рукописи осуществляется автоматизировано, с помощью средств IPT. На основе введенных метаданных формируется черновик (текстовый файл в формате RTF), соответствующий правилам оформления статей. Он становится доступным для загрузки в используемой IPT-инсталляции на странице набора данных после его публикации. При необходимости этот файл можно дополнить иллюстрациями и ссылками на литературные источники.
Как правило, в процессе подготовки рукописи, требуется несколько раз вносить уточнения, как в исходные, так и в метаданные, что, в свою очередь, требует обновления уже опубликованного набора данных. Благодаря функциональным возможностям IPT, обновленные версии публикуются с сохранением истории изменений.
Представленные материалы разработаны на основе трехлетнего опыта проведения авторами тематических семинаров и деятельности неформального сообщества GBIF в России. Приведенные рекомендации никоим образом не являются исчерпывающим руководством в силу специфичности биологических данных и постоянного совершенствования стандартов их описания. Они представляют основные принципы публикации данных и ключевые этапы их стандартизации. Для уточнения деталей при работе с каждым конкретным набором данных необходимо обращаться к источникам, приведенным в списке литературы.
Объединение данных на основе международных стандартов способствует повышению их качества и стимулирует развитие методов их интеграции, хранения, визуализации и анализа. Публикация данных через GBIF.org будет способствовать вовлечению российских исследователей в международные проекты и увеличению числа публикаций в высокорейтинговых изданиях.
Авторы благодарят участников неформального сообщества GBIF в России и участников семинаров, посвященных публикации данных через GBIF.org, за активное участие и вопросы, которые послужили основой этой публикации. Также авторы благодарны рецензентам, замечания и предложения которых способствовали улучшению рукописи.
Айтинские целевые задачи. 2010. URL: https://www.cbd.int/sp/targets/ (28.08.2017).
Веб-ГИС «Фаунистика». 2012. URL: http://rrrcn.ru/ru/birdwatching/web-gis (28.08.2017).
Иванова Н. В., Шашков М. П. Перспективы создания открытого всероссийского информационного ресурса по биоразнообразию на основе международного стандарта GBIF // Математическая биология и биоинформатика, 2014. Т. 9. Вып. 2. С. 396-405. doi: 10.17537/2014.9.396.
Иванова Н. В., Шашков М. П. Спецификация Darwin Core. 2017. URL: http://gbif.ru/DwC_spec (28.08.2017).
Конвенция о биологическом разнообразии. 1992. URL: https://www.cbd.int/doc/legal/cbd-ru.pdf (28.08.2017).
Мелехин А. В., Давыдов Д. А., Шалыгин С. С., Боровичев Е. А. Общедоступная информационная система по Биоразнообразию цианопрокариот и лишайников CRIS (Cryptogamic Russian Information System) // Бюллетень Московского общества испытателей природы. Отдел биологический, 2013. Т. 118. Вып. 6. С. 51-56.
О лицензиях Creative Commons. 2017. Для чего созданы наши лицензии. URL: https://creativecommons.org/licenses/ (28.08.2017).
Access to Biological Collections Data — ABCD. 2015. URL: http://www.tdwg. org/activities/abcd/ (28.08.2017).
Become a publisher. 2017. URL: https://www.gbif.org/become-a-publisher (28.08.2017).
Catalogue of Life. 2015. URL: http://www.catalogueoflife.org/ (28.08.2017).
Chadin I., Dalke I., Zakhozhiy I., Malyshev R., Madi E., Kuzivanova O., Kirillov D., Elsakov V. Occurrences of the invasive plant species Heracleum sosnowskyi Manden. in the Komi Republic territory (European North-East Russia) // PhytoKeys, 2017. Vol. 77. P. 71-80. https://doi.org/10.3897/phytokeys.77.11186.
Chadin I., Dalke I., Zakhozhiy I., Malyshev R., Madi E., Kuzivanova O., Kirillov D. Occurrences of the invasive plant species Heracleum sosnowskyi Manden. in the Komi Republic (Russia). Version 1.8. Institute of Biology of Komi Scientific Centre of the Ural Branch, Russian Academy of Sciences. Dataset / Occurrence. 2016. https://doi.org/10.15468/zo2svq (28.08.2017).
Checklist Data. 2017. URL: https://github.com/gbif/ipt/wiki/checklistData (28.08.2017).
^avan V, Penev L. The data paper: a mechanism to incentivize data publishing in biodiversity science // BMC Bioinformatics, 2011. Vol. 12(15): S2. doi: 10.1186/1471-2105-12-S15-S2.
Costello M. J. Motivating Online Publication of Data // BioScience, 2009. Vol 59. N. 5. P. 418-427. doi:10.1525/bio.2009.59.5.9.
Create your own Darwin Core Archive, How-To Guide (contributed by Remsen D.P., Braak K., Döring M., Robertson T.). Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility, 2011. 20 pp. URL: http://www.gbif.jp/v2/pdf/gbif_dwc-a_how_to_guide_en_v1.pdf (28.08.2017).
Darwin Core Terms: A quick reference guide. 2015. URL: http://rs.tdwg.org/dwc/terms/ (28.08.2017).
Data papers. 2017. URL: https://www.gbif.org/data-papers (28.08.2017).
Dataset classes. 2017. URL: https://www.gbif.org/dataset-classes (28.08.2017).
Ecological Metadata Language (EML). 2017. URL: https://knb.ecoinformatics.org/#external//emlparser/docs/index.html (28.08.2017).
GBIF Backbone Taxonomy. GBIF Secretariat. Checklist Dataset. 2016. URL: https://doi.org/10.15468/39omei(28.08.2017).
Guide to Best Practices for Georeferencing / eds. Chapman A.D., Wieczorek J. Global Biodiversity Information Facility: Copenhagen, 2006. 90 pp. URL: http://herpnet.org/herpnet/documents/biogeomancerguide.pdf (28.08.2017).
Khanina L., Zaugolnova L., Smirnova O., Shovkun M., Glukhova E. Dataset «Flora of vascular plants in the Central European Russia» Institute of Mathematical Problems of Biology, Russian Academy of Sciences. Dataset Species checklist, 2016. doi: 10.15468/96gqtn.
Melechin A. Specimens of lichen herbarium KPABG. Version 1.3. Polar-Alpine Botanical Garden-Institute of N. A. Avrorin KSC RAS. Occurrence Dataset. 2016. URL: https://doi.org/10.15468/nctfm2 (28.08.2017).
Occurrence Data. 2017. URL: https://github.com/gbif/ipt/wiki/occurrenceData. (28.08.2017).
Penev L., Mietchen D., Chavan V., Hagedorn G., Smith V., Shotton D., Tuama E. O., Senderov V., Georgiev T., Stoev P., Groom Q., Remsen D., Edmunds S. Strategies and guidelines for scholarly publishing of biodiversity data // Research Ideas and Outcomes, 2017. Vol. 3: e12431. https://doi.org/10.3897/rio.3.e12431.
Petrosyan V., Kuzmin S. Amphibians of the Former USSR. Version 1.11. A. N. Severtsov Institute of Ecology and Evolution, Russian academy of sciences. Occurrence Dataset, 2017. URL: https://doi.org/10.15468/wxz3yj (28.08.2017).
Resource Metadata. 2017. URL: https://github.com/gbif/ipt/wiki/resourceMetadata (28.08.2017).
i Не можете найти то, что вам нужно? Попробуйте сервис подбора литературы.
Robertson T., Döring M., Guralnick R., Bloom D., Wieczorek J., Braak K., Otegui O., Russell L., Desmet P. The GBIF Integrated Publishing Toolkit: Facilitating the Efficient Publishing of Biodiversity Data on the Internet // PLoS ONE, 2014. Vol. 9(8): e102623. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0102623.
Sampling Event Data. 2017. URL:
Seregin A. P. Making the Russian flora visible: Fast digitization of the Moscow University Herbarium (MW) in 2015 // Taxon, 2016. Vol. 65. № 1. P. 205-207. http://dx.doi.org/10.12705/651.29.
Seyfulina R., Buyvolov Y. List of Spiders of Prioksko-Terrasnyi Biosphere Reserve. Prioksko-Terrasnyi Biosphere Reserve. Occurrence Dataset. 2016. URL: https://doi.org/10.15468/3cbyt7 (28.08.2017).
Shashkov M., Ivanova N. Database of finds of rare lichen species Lobaria pulmonaria in Russia. Version 1.4. Institute of Mathematical Problems of Biology, Russian Academy of Sciences. Occurrence Dataset, 2016. URL: https://doi.org/10.15468/uennht (28.08.2017).
Smirnov R., Golikov A., Khalikov R. Catalogue of the type specimens of Pogonophora (Annelida; seu Polychaeta: Siboglinidae) from research collections of the Zoological Institute, Russian Academy of Sciences. Version 1.1. Zoological Institute, Russian Academy of Sciences, St. Petersburg. Dataset/Checklist. 2017. URL: https://doi.org/10.15468/1mlkdp (28.08.2017).
TDWG. Biodiversity Information Standards. 2017. URL: http://www.tdwg.org/ (28.08.2017).
Volkovitsh M., Golikov A., Khalikov R. Catalogue of the type specimens of Polycestinae (Coleoptera: Buprestidae) from research collections of the Zoological Institute, Russian Academy of Sciences. Version 1.10. Zoological Institute, Russian Academy of Sciences, St. Petersburg. Checklist Dataset. 2017. URL: https://doi.org/10.15468/c3eork (28.08.2017).
Wieczorek J., Bloom D., Guralnick R., Blum S., Dorring M., Gilovanni R., Robertson T., Vieglais D. Darwin core: An Evolving Community-Developed Biodiversity Data Standard // PLoS ONE, 2012. Vol. 7. №. 1. P. 1-8. doi.org/10.1371/journal.pone.0029715.
Wieczorek C., Wieczorek J. Georeferencing Calculator (version 20160929). Museum of Vertebrate Zoology, University of California, Berkeley. 2015. URL: http://manisnet.org/gci2.html (28.08.2017).
Сведения об авторах
Шашков Максим Петрович,
Магистр биологии, старший научный сотрудник Института математических проблем биологии РАН — филиала Федерального государственного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт прикладной математики им. М. В. Келдыша РАН», научный сотрудник Федерального государственного бюджетного учреждения науки института физико-химических и биологических проблем почвоведения РАН, Пущино; Max. carabus@gmail.com Чадин Иван Федорович,
Кандидат биологических наук, заместитель директора по научной работе Федерального государственного бюджетного учреждения науки Института биологии Коми НЦ Уральского отделения РАН, Сыктывкар; chadin@ib.komisc.ru Иванова Наталья Владимировна,
Магистр биологии, научный сотрудник Института математических проблем биологии РАН — филиала Федерального государственного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт прикладной математики им. М. В. Келдыша РАН», Пущино; Natalya.dryomys@gmail.com
Shashkov Maxim Petrovich,
Master of science (biology), Senior Researcher of Institute of Mathematical Problems of Biology RAS — the Branch of Keldysh Institute of Applied Mathematics of RAS, Researcher of Institute of Physicochemical and Biological Problems in Soil Science Russian Academy of Science, Pushchino; Max.carabus@gmail.com Chadin Ivan Fedorovich
PhD, Deputy Director of Institute of Biology of Komi Scientific Centre of the Ural Branch of RAS, Syktyvkar; chadin@ib.komisc.ru Ivanova Natalya Vladimirovna,
Master of science (biology), Researcher of Institute of Mathematical Problems
of Biology RAS — the Branch of Keldysh Institute of Applied Mathematics of RAS, Pushchino;
Natalya. dryomys@gmail. com